| MirGeneDB ID | Neu-Mir-137-P3 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
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| Family name | MIR-137 (all species) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Species | Tammar Wallaby (Notamacropus eugenii) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| MiRBase ID | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Paralogues | Neu-Mir-137-P1 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Orthologues | Aca-Mir-137-P3-v1 Aga-Mir-137 Agr-Mir-137 Ami-Mir-137-P3-v1 Asu-Mir-137 Ava-Mir-137 Bfl-Mir-137 Bko-Mir-137 Bpl-Mir-137 Cbr-Mir-137 Cel-Mir-137 Cli-Mir-137-P3 Cpi-Mir-137-P3-v1 Cte-Mir-137 Dan-Mir-137 Dgr-Mir-137 Dma-Mir-137 Dme-Mir-137 Dmo-Mir-137 Dpu-Mir-137 Dsi-Mir-137 Dya-Mir-137 Eba-Mir-137 Ebu-Mir-137 Esc-Mir-137 Gga-Mir-137-P3-v1 Gja-Mir-137-P3 Gmo-Mir-137-P3a-v1 Gmo-Mir-137-P3b-v1 Gpa-Mir-137 Hme-Mir-137 Hru-Mir-137 Isc-Mir-137 Lan-Mir-137 Lch-Mir-137-P3 Lgi-Mir-137 Lhy-Mir-137 Llo-Mir-137 Loc-Mir-137-P3-v1 Mal-Mir-137-P3a-v1 Mal-Mir-137-P3b-v1 Mdo-Mir-137-P3-v1 Mgi-Mir-137 Mom-Mir-137 Mun-Mir-137-P3 Oan-Mir-137-P3-v1 Obi-Mir-137 Ofu-Mir-137 Pau-Mir-137 Pbv-Mir-137-P3-v1 Pca-Mir-137 Pdu-Mir-137 Pma-Mir-137-o3 Pve-Mir-137 Rph-Mir-137 Sha-Mir-137-P3 Sko-Mir-137 Snu-Mir-137 Spu-Mir-137 Tni-Mir-137-P3b Tur-Mir-137 War-Mir-137 Xbo-Mir-137 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (locus) | Gnathostomata | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Node of Origin (family) | Bilateria | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Genome context (GCA_028372415.1_mMacEug1.pri) |
CM051816.1: 78535114-78535172 [-] UCSC Ensembl | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Seed | UAUUGCU | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Precursor (pre-Mir +30nt flank) |
CCCUAGCCUAAUGGCUGGCCCCCCGCGAUGACGGGUAUUCUUGGGUAGAUAAUACCGAUGGCGCUGUUAUUGCUUGAGAAUACACGUAGUCGAGGGGAGGCGCCUUCGACGACCCCCUCGet precursor sequence |
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| Structure | 10 20 30 40 50 CCCUAGCCUAAUGGCUG- -| G G G UG A CCGA GCC CCCC CGAU ACG GUAUUCU GGUAG UAAUA U CGG GGGG GCUG UGC CAUAAGA UCGUU AUUGU G CUCCCCCAGCAGCUUCCG A^ A A A GU - CGCG 110 100 90 80 70 60 | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Deep sequencing | |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| 3' NTU | No | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Motifs | CNNC at 3p(+17) | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Tissue expression
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| Star sequence | Neu-Mir-137-P3_5p* (predicted) |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
0- ACGGGUAUUCUUGGGUAGAUAAUA -24
Get sequence
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| Mature sequence | Neu-Mir-137-P3_3p |
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| mirBase accession | None | ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
| Sequence |
36- UUAUUGCUUGAGAAUACACGUAG -59
Get sequence
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